Исследовательская группа ERGљ(ERG Research Group) является творческим коллективом молодых ученых, аспирантов и студентов, руководимым кандидатом физико-математических наук, доцентом кафедры биофизики Биологического факультета МГУљКрасильниковым Павлом Михайловичем. Научная группа ERG была образована в 2004 году для проведения фундаментальных исследований в области биофизики. Основной задачей группы является теоретическое исследование механизмов различных молекулярных процессов, протекающих в биологических системах. В силу известной сложности биосистем, основным инструментом теоретического исследования является компьютерное моделирование, основанное на применении, как методов вычислительной квантовой химии, так и методов молекулярной динамики. Вместе с тем подчеркнем, что в группе также проводятся теоретические исследования в традиционном понимании, т.е. с использованием математического аппарата и методов теоретической физики.
В настоящее время (2015 г.) группа ERG состоит из шести человек
- Красильников Павел Михайлович, руководитель лаборатории, которому, без колебаний, можно отправить письмо на следующие электронные адреса: krapam@mail.ru; pavel@erg.biophys.msu.ru; krasilnikov@biophys.msu.ru
- Зленко Дмитрий Владимирович, сотрудник лаборатории, dvzlenko@gmail.com
- Ярошевич Игорь Александрович, аспирант лаборатории
- Омарова Анна Георгиевна, аспирант лаборатории
В различные периоды времени в группе проходили обучение и плодотворно работали наши товарищи
- Новикова Полина Юрьевна
- Дюба Артем
- Голик Дмитрий
- Алексей Нестеренко
- Петр Мамонов
- Дмитрий Кукушкин
- Антон Колганов
Основные направления исследований
I.љМоделирование процессов электронного и протонного транспорта
- Изучение механизмов электронного переноса в первичных процессах разделения заряда в фотосинтетических реакционных центрах. Изучение общих электрон-транспортных свойств белковых макромолекул (биополимеров).
- Квантовая химия молекул. Расчет электронных состояний макромолекул. Расчет электронных и электрон-колебательных спектров макромолекул.
- Водородная связь. Свойства водородной связи. Моделирование протонной проводимости по системе водородных связей в молекулярных структурах.
- Изучение латеральной подвижности протонов и других ионов в гидратных слоях на поверхности липидных мембран и белков.
- Гидратация, диффузия и взаимодействие ионов металлов в водных средах.
- Исследование сопряжения процесса электронного переноса в биосистемах с динамикой водородных связей.
II.љМоделирование липидных мембран
- Исследование температурных фазовых переходов в бислойных липидных мембранах.
- Исследование белок ? липидных взаимодействий.
- Аналитическое моделирование динамики замкнутой липидной мембраны ? везикулы (оболочечная модель): колебания, поверхностные упругие волны, устойчивость, влияние заряда на динамику липидного бислоя.
III. Структура и динамика белка
- Моделирование процесса гидратации белковых макромолекул.
- Исследование влияния водородных связей на структуру и конформационную динамику белковых молекул.
- Исследование взаимодействия макромолекул с ионами металлов.
IV. Моделирование биохимических реакций
- Моделирование процессов перекисного окисления липидов.
- Нелинейная термодинамика в биологии.
Исследования проводятся в тесном контакте, как с экспериментальными, так и с теоретическими лабораториями кафедры биофизики Биологического факультета МГУ, кафедры биофизики Физического факультета МГУ, а также с лабораторией химической кибернетики Химического факультета МГУ.