В соответствии с функционально-структурной иерархией АСИО должна быть реализована в виде системы баз данных (БД).

Должны быть выполнены принципы стандартизации/унификации и интеграции в рамках единой (интегрированной, распределенной) информационно-программной системы информации (данных) различных уровней отражения предметной области (понятийно-терминологические данные - регистрационные данные - агрегированные данные - элементарные/локальные модели - классификационные/нелокальные или сложные модели - метамодели/отношения моделей и т. д.) с обеспечением единого информационного и функционального пространства. Основными особенностями программной реализации являются рассмотрение моделей как специфического информационного ресурса баз данных АСИО, включение в состав БД АСИО связанных структурированных и индексированных библиографических, реферативных и полнотекстовых источников и численных данных (исходных, агрегированных, категорированных, оцененных).

Для обеспечения быстроты реализации разработка должна производиться итерационно, 'раскруткой' и интеграцией исследовательских прототипов подсистем.

В следующем разделе описываются результаты выполнения первого этапа работ: разработка информационных моделей химических объектов (химических структур, реакций, композиций, материалов, химико-технологических схем, процессов и аппаратов, аналитических методов); разработка проектов и прототипов баз данных регистров химических информационных объектов; разработка проекта и прототипов программного обеспечения пользовательских интерфейсов регистров химических информационных объектов; разработка проектов и прототипов автоматизированных рабочих мест по переработке входного потока информации (извлечения, формализации и регистрации данных по химическим объектам).