А. И. Рыхлевская, О. М. Сидоркина, Е. А. Романова, Т. С. Орецкая, Ж. Лаваль, С. А. Кузнецова
Определение контактов фосфатных групп ДНК с
нуклеофильными аминокислотами фермента репарации формамидопиримидин-ДНК гликозилазы
E. сoli
Реферат
Для
зондирования активного центра Fpg E. coli и определения контактов белка
с фосфатными группами в ДНК использовали набор реакционноспособных аналогов
субстратов, содержащих в своей структуре одновременно остаток 8-OG и
тризамещенные пирофосфатные межнуклеотидные группировки в различных положениях
по отношению к нему. Модифицированные ДНК-дуплексы были получены методом
химического лигирования. Изучены свойства и реакционная способность
синтезированных аналогов субстратов, исследовано их взаимодействие с Fpg E.
coli, определены константы диссоциации ДНК-белковых комплексов. Изучено
каталитическое расщепление модифицированных ДНК-дуплексов Fpg и найдены новые
негидролизуемые аналоги субстратов этого фермента. Подобраны оптимальные
условия для ковалентного связывания реакционноспособных ДНК-дуплексов с
ферментом и получены специфические ковалентные ДНК-белковые комплексы, что
позволило определить контакты нуклеофильных аминокислот Fpg E. coli с
фосфатными группами ДНК.
Полный текст статьи в формате PDF
Вестник Московского Университета.
Химия 2000, том 41, ? 6, стр. 375-379
Copyright (C) Химический факультет МГУ, 2000
|