Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://aspirant.phys.msu.ru/special_courses/autumn/Sveshnikova.doc Дата изменения: Wed Sep 16 12:07:44 2015 Дата индексирования: Sun Apr 10 00:19:20 2016 Кодировка: koi8-r

Компьютерные модели в биологии клетки


Лектор: Свешникова Анастасия Никитична, канд. физ.-мат. наук, ст.н.с.
кафедры биофизики физического факультета МГУ

В рамках спецкурса будут изучены следующие темы. Понятие математической
модели в биологии, типы моделей. Запись и чтение модели на языке системной
биологии (SBML). Компьютерные базы данных. Особенности численных методов
моделирования кинетических систем и их компьютерная реализация.
Традиционные методы исследования гомогенной системы. Возможности и
ограничения комплекса методов, базирующихся на анализе чувствительности.
Бифуркационный анализ и его компьютерная реализация. Модели типа "реакция-
диффузия", активные распределенные среды. Гомогенная модель Жакоба-Моно -
биологический триггер. Гомогенная и распределенная модель "брюсселятор".
Модели колебаний в гликолизе и колебаний внутриклеточного кальция.
Компьютерная реализация электрофизиологических процессов. Точечная модель
Морриса-Лекара, модель Ходжкина-Хаксли. Модель ФитцХью-Нагумо,
распространение импульса в возбудимой среде. Стохастические модели в
биологии клетки. Потоковые модели метаболизма. Логические и вероятностные
модели для генетических регуляторных сетей.