Кафедра антропологии тесно связана с Институтом и Музеем антропологии МГУ, сотрудники которого также преподают на кафедре, и где многие студенты и аспиранты выполняют свои научные работы,

с Лабораторией пластической реконструкции ИЭИА РАН,

сектором антропологии ИЭИА РАН,

Институтом общей генетики РАН,

Институтом медицинской генетики РАМН,

Центром судебно-медицинской экспертизы РАМН