Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://mouse.belozersky.msu.ru/npidb/data/pdb_new/Hbond/3k58.pdb1.pdb.hb.txt Дата изменения: Mon Oct 8 06:25:57 2012 Дата индексирования: Mon Feb 4 08:33:16 2013 Кодировка:

# File 3k58.pdb1.pdb, PDB XXXX
# Hydrogen bonds
# NA Atom Protein Atom Dist. Theta1 Theta2 Phi1 Phi2 Power
DT802:T.O5'/1 GLY259:A.N/1 2.95 -1.00 0.73 0.00 2.23 0.553
DA804:T.OP2/1 VAL370:A.N/1 2.94 0.98 0.16 2.52 -0.62 0.843
DA807:T.OP1/1 GLY401:A.N/1 3.21 1.43 0.34 1.62 -1.53 0.353
DG809:T.OP1/1 LYS614:A.N/1 3.18 0.73 0.63 1.63 -1.51 0.209
DC810:T.OP2/1 ARG607:A.N/1 2.75 1.06 0.04 2.76 -0.38 0.951
DT811:T.OP2/1 ARG607:A.NH1/1 2.94 1.17 0.87 2.37 -0.78 0.673
DA812:T.OP2/1 ARG755:A.NH1/1 2.63 1.06 1.00 -1.13 2.01 0.842
DG813:T.OP1/1 ARG704:A.NH2/1 3.02 0.93 1.67 -0.81 2.33 0.152
DG814:T.OP1/1 VAL699:A.N/1 3.02 1.07 0.60 1.37 -1.77 0.658
DG908:P.OP2/1 ARG690:A.NH1/1 3.18 1.28 0.46 -0.26 2.88 0.120
DC909:P.OP1/1 ARG689:A.N/1 3.33 1.09 0.13 0.36 -2.78 0.305
DC909:P.OP1/1 TYR695:A.OH/1 2.84 1.04 1.00 -0.80 2.34 0.729
DC909:P.OP1/1 HIS702:A.NE2/1 3.07 0.91 0.30 0.54 -2.60 0.612
DC909:P.OP2/1 ARG689:A.NE/1 2.98 1.26 0.21 1.90 -1.24 0.901
DG910:P.OP1/1 ARG687:A.N/1 3.04 1.05 0.15 -0.48 2.66 0.824
DG910:P.OP2/1 ARG687:A.NH1/1 2.83 1.36 0.71 1.16 -1.98 0.358
DG910:P.N3/1 ARG638:A.NH1/1 3.22 0.23 1.01 1.34 -1.80 0.665
DT911:P.OP1/1 VAL637:A.O/1 3.13 0.97 0.95 2.35 -0.79 0.212
DT911:P.OP1/1 THR639:A.N/1 2.97 1.00 0.30 -0.37 2.77 0.838
DA912:P.OP1/1 GLY633:A.N/1 2.67 0.96 0.50 -2.73 0.41 0.726
DA912:P.N3/1 LYS615:A.NZ/1 2.87 0.34 1.28 3.07 -0.07 0.890
DOC913:P.OP1/1 TYR617:A.OH/1 2.54 0.99 1.17 1.48 -1.66 0.865
# Water bridges
# NA Atom Protein Atom NA-HOH Prot.-HOH Theta1 Theta2 Phi1 Phi2 Power
DA803:T.OP2/1 ARG365:A.NE/1 2.78 2.96 1.39 0.15 0.95 -2.43 0.688
DA803:T.OP2/1 HIS366:A.O/1 2.78 2.65 1.39 0.29 0.95 -1.64 0.100
DA803:T.OP2/1 GLY368:A.N/1 3.02 2.78 1.40 0.10 2.05 -1.32 0.382
DA804:T.OP1/1 GLY368:A.N/1 2.76 2.78 0.96 0.10 0.32 -1.32 0.806
DA804:T.OP1/1 SER369:A.N/1 2.51 3.28 1.20 0.33 1.74 -0.95 0.387
DA804:T.OP1/1 SER369:A.OG/1 2.51 3.00 1.20 1.47 1.74 -0.57 0.322
DA804:T.OP2/1 ALA371:A.N/1 2.75 2.87 0.37 0.34 -0.05 -0.58 0.164
DG805:T.OP1/1 THR505:A.OG1/1 2.83 2.87 1.12 1.19 -0.44 0.36 0.741
DG805:T.N2/1 TYR500:A.OH/1 3.06 2.74 1.28 0.90 -2.46 1.57 0.568
DG805:T.N3/1 TYR500:A.OH/1 3.39 2.74 0.58 0.90 -3.01 1.57 0.125
DT806:T.OP1/1 SER399:A.N/1 2.91 2.95 0.99 0.38 -3.10 0.24 0.621
DT806:T.O4'/1 TYR500:A.OH/1 3.07 2.74 0.52 0.90 1.80 1.57 0.258
DT806:T.O2/1 GLY402:A.N/1 2.76 2.66 0.94 0.09 2.71 -0.03 0.776
DA807:T.O4'/1 LYS615:A.NZ/1 3.01 2.61 0.74 1.42 1.43 -2.07 0.202
DC808:T.OP1/1 VAL404:A.N/1 2.85 3.02 1.18 0.16 2.85 -1.63 0.796
DG809:T.OP1/1 GLY612:A.O/1 2.70 2.70 0.88 0.51 3.12 -1.15 0.171
DC810:T.OP1/1 THR605:A.O/1 2.72 3.13 1.17 0.88 2.19 0.10 0.221
DC810:T.OP1/1 SER613:A.OG/1 2.72 2.85 1.17 1.57 2.19 0.18 0.318
DC810:T.OP1/1 ARG616:A.NE/1 2.72 2.88 1.17 0.52 2.19 -2.98 0.855
DT811:T.OP1/1 GLU635:A.OE2/1 2.81 2.63 1.15 0.57 1.96 -1.74 0.277
DT811:T.OP1/1 ARG755:A.O/1 2.95 2.48 1.11 0.92 -0.21 -2.30 0.513
DA812:T.OP1/1 TYR684:A.OH/1 2.80 2.76 1.04 1.11 1.41 -2.63 0.843
DA812:T.OP1/1 GLN756:A.OE1/1 2.80 3.12 1.04 0.79 1.41 -1.49 0.164
DG813:T.OP1/1 ARG704:A.NH1/1 3.13 2.77 0.98 1.32 -0.26 -2.24 0.233
DA907:P.N3/1 ASN698:A.ND2/1 2.61 3.00 0.32 0.76 -0.08 1.75 0.481
DG910:P.OP1/1 THR639:A.OG1/1 2.86 2.79 0.69 1.47 1.36 -0.83 0.196
DG910:P.OP1/1 ARG685:A.O/1 2.86 2.81 0.69 0.87 1.36 2.67 0.233
DG910:P.OP2/1 ARG689:A.NH1/1 2.88 3.21 1.10 0.85 3.01 1.39 0.291
DG910:P.N7/1 ARG689:A.NH1/1 2.99 2.91 0.02 1.16 -1.24 3.05 0.953
DT911:P.OP2/1 THR639:A.OG1/1 2.89 2.93 1.09 1.14 -0.18 0.14 0.556
DT911:P.OP2/1 ARG687:A.NH1/1 2.89 2.98 1.09 1.47 -0.18 1.99 0.430
DT911:P.OP2/1 ARG687:A.NH2/1 2.89 2.94 1.09 1.44 -0.18 2.72 0.501
DA912:P.OP1/1 PHE631:A.O/1 2.81 2.94 1.02 0.49 1.14 -0.64 0.137
DA912:P.O3'/1 TYR543:A.OH/1 2.97 2.69 0.67 1.12 -2.86 0.54 0.412
DA912:P.O3'/1 ASP545:A.OD2/1 2.97 2.71 0.67 1.04 -2.86 1.31 0.385
DOC913:P.OP1/1 TYR543:A.OH/1 2.87 2.69 1.48 1.12 -1.95 0.54 0.463
DOC913:P.OP1/1 ASP545:A.OD2/1 2.87 2.71 1.48 1.04 -1.95 1.31 0.432
DOC913:P.OP1/1 SER548:A.OG/1 2.95 2.85 1.16 1.42 2.58 0.19 0.405