Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/year_05/term4/add_f2.html
Дата изменения: Mon Mar 19 18:10:55 2007
Дата индексирования: Tue Oct 2 07:01:12 2012
Кодировка: Windows-1251
Дополнительные упражнения на бонусные баллы к занятию 5

Занятие 6. Классификация функций. Коды ферментов.

Дополнительные упражнения

  1. Используйте средства специализированного ресурса Brenda для характеристики заданного Вам фермента (1 балл)
  2. Все упражнение выполняйте используя опцию "Quick search" , т.е. стартуя с главной странички.

    Проведите поиск заданного Вам фермента по его коду. Нужно получить 1 строчку, в которой можно найти ссылки на схему ферментативной реакции, перечень всех последовательностей и полное описание. Скопируйте рисунок со схемой ферментативной реакции для отчета. В отчете ответьте также на следующие вопросы:

    1. Сколько всего ферментов с таким кодом описано в БД?
    2. Какая субъединичная структура характерна для ферментов данного типа?
    3. Какие бывают пострансляционные модификации у таких ферментов?
    4. Какие болезни человека так или иначе связаны с данным ферментом?

  3. Сравните аннотации функций в БД GOA у 3-х ферментов из далеких организмов. Сравните эти аннотации с аннотациями в UniProt (2 балла)
  4. Работать надо с теми белками, которые были найдены и исследованы в обязательном упражнении ?2. В отчете надо привести запросы.

  5. Используйте средства специализированного ресурса Brenda для сравнения cвойств 2-х ферментов из далеких организмов (1 балл)
  6. Выберите любые 2 фермента из исследованных в упр.2. Сравните оптимум рН этих ферментов. Определите, известны ли ингибиторы и активаторы данных ферментов.