Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.cmm.msu.ru/~moshka/Term2/Practice4/T_Alignment.html
Дата изменения: Sun Oct 17 22:36:26 2010 Дата индексирования: Fri Feb 11 09:01:37 2011 Кодировка: Windows-1251 |
Заданный фрагмент соответствует позициям 61-97 в полной последовательности белка FDNG_Ecoli.
Был получен файл с выравниванием. И изображение:
37 и 39
45
W=M - nG (где M - число совпавших букв, G - штраф за пропуск, равен 2, n - общее число пропусков).
W = 20 - 2 * 1 = 18.
20/45 * 100 = 44
1
лейцин (L, leucine) и метионин (M, methionine)
2
Они обладают общим физико-химическим свойством - они неполярны, но из-за различия в атомном составе эта пара имеет 2.