Революция в молекулярной биологии, связанная с развитием методов
чтения ДНК, особенно с прочтением генома человека в последние годы, привела к
бесспорному пониманию того факта, что генетика не может обойтись без
математического анализа последовательностей нуклеиновых кислот и белков с целью
прочтения, расшифровки и предсказания их функций. Возникшая новая дисциплина -
компьютерная генетика, кажется, исполняет эту роль более или менее успешно. Но
еще в 1989 году один из разработчиков математических методов в генетике
М.С.Уотермен писал, что 'одной из нерешенных проблем является создание
программного обеспечения для простого доступа к данным. Для пользователя крайне
важно уметь обращаться к данным на биологически осмысленном языке. До тех пор,
пока это не сделано, пользователи вынуждены писать громоздкие промежуточные
процедуры, связывающие их программы анализа и базы данных. В ближайшем
будущем мы ожидаем создания одной международной базы данных с системой
обработки данных'. Прошло с тех пор 12 лет, проблема, кажется, не сдвинулась с
места. А вместе с тем объем генетической информации катастрофически возрос, что
еще острее ставит проблему, сформулированную М.С.Уотерменом.
Смысл нашего семинара заключается в том, чтобы на примере нескольких актуальных
задач генной инженерии соединить воедино усилия как биологов и вычислителей, так
и математиков других специальностей, чтобы попытаться найти более
удовлетворительное решение проблемы создания адекватных математических
моделей различных процессов молекулярной биологии, с тем, чтобы на их основе
можно было бы создать такое программное обеспечение, которое бы, по словам
М.С.Уотермена позволяло 'обращаться к данным на биологически осмысленном
языке'.
|
|