Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://cellmotility.genebee.msu.ru/html/protocols/dinamika.htm
Дата изменения: Tue Jun 18 17:20:02 2002
Дата индексирования: Mon Oct 1 20:04:31 2012
Кодировка: Windows-1251
динамика

Динамика МТ - измерение мгновенных приращений

1. Получить координаты концов МТ на кадрах i и i+1.

Реально для каждой МТ используются три точки - (x 0 , y 0), (x i , y i), (x i+1 , y i+1). Первая точка располагается на прямой, связывающей вторую и третью точку, на максимальном удаление от второй и третьей точек.

Для увеличения статистики можно использовать несколько пар кадров в одном фильме с условием, что интервал между разными парами кадров не меньше 20 кадров.

2. Перенести матрицу данных в SigmaPlot. Матрица должна выглядеть:

col(1) col(2)
kx 0 ky 0
kx i ky i
kx i+1 ky i+1
k+1x 0 k+1y 0
k+1x i k+1y i
k+1x i+1 k+1y i+1
... ...

где k - номер микротрубочки

3. Получить смещения концов МТ в микрометрах.

можно использовать следующий User-Defined Transform (F10):

for i = 2 to size(col(1)) step 3 do
cell(3;i)=sqrt((cell(1;i)-cell(1;i-1))^2+(cell(2;i)-cell(2;i-1))^2)
cell(3;i+1)=sqrt((cell(1;i+1)-cell(1;i-1))^2+(cell(2;i+1)-cell(2;i-1))^2)
cell(4;i+1)=cell(3;i+1)-cell(3;i)
end for
col(5)=col(4)/11.1

4. Построить гистограмму смещений.

Гистограмма строится с интервалом 0,4 мкм.
Нулевая точка располагается в интервале (-0,2; 0.2] и обозначается 0. Остальные точки располагаются по отношению к нулевой точке.

можно использовать следующий User-Defined Transform (F10):

x_col=8
res=11
min=-6.2
max=6.2
interval=0.4
x=col(x_col)
historange = data(min;max;,interval)
h=histogram(x;historange)
int2=interval/2
y=h[data(2;size(h)-1)]
col(res)=historange[data(1;size(historange)-1)]
+int2
col(res+1)=y



вернуться