Astronet Поиск по астрономическим сайтам English Russian
       
        Точная форма слов   О проекте   Сайты   Справка
Поиск по:   - Поискать по всем серверам
На этой странице приведены все страницы, которые ссылаются на http://kodomo.cmm.msu.ru/~anya_fbb/gom.fasta. Показаны документы 1 - 1 из 1.

1. Task 4
... Проведем поиск программой BLASTP (с порогом E-value, равным 0.0001) в файле proteo.fasta и отберем те находки, которые относятся к выбранным бактериям.Получим последовательность белка FTSH_ECOLI в fasta-формате с помощью команды: seqret sw:FTSH_ECOLI Cоздадим индексные файлы пакета BLAST: formatdb -i proteo.fasta -p T -n index Поищем гомологи программой BLASTP c порогом E-value, равным 0.0001: blastall -p blastp -d index -i ftsh_ecoli.fasta -o gomologi.txt -e 0.0001 Получили файл gomologi . ...
[ Сохраненная копия ]  Ссылки http://kodomo.cmm.msu.ru/~anya_fbb/TREE4.html -- 6.4 Кб -- 21.03.2010
Похожие документы


Астронет | Научная сеть | ГАИШ МГУ | Поиск по МГУ | О проекте | Авторам

Комментарии, вопросы? Пишите: info@astronet.ru или сюда

Rambler's Top100 RFBR Яндекс цитирования