Микроспутник - это своеобразное учебное пособие, достаточно дорогое и сложное, в первую очередь, из-за применения в нем высоких технологий, недоступных для системы образования. Поэтому к научной и технической реализации проектов МС привлекаются организации и предприятия ракетно-космической отрасли:

• РКК "Энергия" им. С.П. Королева,
  
• Институт космических исследований Российской Академии наук (ИКИ РАН),
  
• Специальное конструкторское бюро космического приборостроения ИКИ РАН,
• Научно-исследовательская лаборатория аэрокосмической техники Российской оборонной спортивно-технической организации (НИЛАТ РОСТО), г. Калуга
  
• Институт земного магнетизма, ионосферы и распространения радиоволн РАН (ИЗМИРАН),
  
• НИИ ядерной физики Московского государственного университета имени М.В. Ломоносова,
  
• Институт атомной энергетики и др.

Предполагается, что координатором работ по Программе МС будет являться межрегиональная общественная организация "Микроспутник" (МОО "МС"), созданная на некоммерческой основе и состоящая из участников первого проекта.
Участниками Программы МС могут являться учащиеся и преподаватели средних и высших учебных заведений, сотрудники научных и промышленных предприятий ракетно-космической отрасли как России, так и зарубежных стран.