Учебные дисциплины

Современные проблемы молекулярной биофизики

Шайтан К.В.

Программа

• Проблема сворачивания полипептидной цепи в уникальную третичную структуру
• Парадокс Левинталя
• Численные эксперименты
• Корреляция флуктуаций аминокислотных остатков и проблема "ущелья" на поверхности потенциальной энергии
• Стадии процесса денатурации - ренатурации полипептидной цепи
• Молекулярная динамика белков - от первых работ к моделированию функциональных процессов
• Методы изучения и модели динамического поведения биополимеров
• Мессбауэровская спектроскопия и рентгенодинамический анализ
• Диффузия лигандов в миоглобине
• Представления о конформационных подсостояниях
• "Белкотрясение"
• Эффекты вязкости растворителя и теория диффузии в структурированных средах
• Туннельный перенос электрона в белках
• Роль особенностей структуры РЦ в организации путей электронного транспорта
• Взаимодействие электронных и ядерных степеней свободы по данным фемптосекундной лазерной спектроскопии
• Неравновесные состояния биополимеров
• Эффекты памяти и способа приготовления образца на его функциональное состояние (на примере РЦ и миоглобина)
• О концепции белок - стекло
• Упругие свойства белковых кристаллов и белковых глобул
• Модуль Юнга и модуль сдвига
• Эффекты влажности, температуры и денатурации
• Вязкоупругие свойства белков
• Вклад различных взаимодействий в упругость глобулы
• Нанотехнологии и молекулярные машины
• Использование методов туннельной микроскопии для конструирования молекулярных систем
• Использование идей и методов молекулярной биологии в микроэлектронике
• Симметрия в биологических системах
• Проблема скрытой симметрии
• Квазикристаллы
• Динамика относительно небольших биомолекулярных систем
• Корреляция конформационных флуктуаций и коллективные степени свободы
• Карты уровней свободной энергии
• Сравнение с картами Рамачандрана и картами уровней потенциальной энергии
• Соотношение между динамической корреляцией и топографией поверхности свободной энергии
• О проблеме взаимодействия между классическими и квантовыми степенями свободы в элементарном акте функционирования биомакромолекул
• Возможные последствия квантового параметрического резонанса
• Проблема запасания и трансформации энергии при функционировании ферментов
• Эффекты, связанные с колебательной и конформационной релаксацией
• Роль структуры поверхности конформационной энергии и неоднозначности путей конформационной релаксации (на примере ферредоксина)
• Флуктуации атомных зарядов при конформационных изменениях в полипептидах
• Современные самообучающиеся информационные системы для вероятностного прогнозирования физиологических свойств молекул по набору структурно-динамических параметров
• Проблема молекулярного дизайна
• Современные технологии при обработке экспериментальных данных
• Решение некорректных задач
• Математические и физические модели
• Мессбауэровская фурье-спектроскопия
• Фемпто- и пикосекундная спектроскопия