Хроника подготовки и полета корабля 'Союз МС-06'
с экипажем экспедиции МКС-53/54 (ISS-52S)

13 марта 2015 года. На форуме журнала 'Новости космонавтики' появилось сообщение о назначении Сергея Прокопьева командиром, а Евгения Тарелкина бортинженером основного экипажа корабля 'Союз МС-06'.

1 июня 2015 года приказом начальника Центра подготовки космонавтов Евгений Тарелкин освобожден от должности космонавта-испытателя и уволен из ЦПК по собственному желанию. Таким образом место бортинженера стало вновь вакантным.

В марте 2015 года на форуме журнала 'Новости космонавтики' появилось сообщение о назначении Олега Артемьева бортинженером основного экипажа корабля 'Союз МС-06'.

08 сентября 2015 года. На форуме журнала 'Новости космонавтики' появилось сообщение о предварительном назначении в основной экипаж корабля 'Союз МС-06' Александра Скворцова и Дениса Матвеева, а в дублирующий экипаж - Сергея Прокопьева и Евгения Тарелкина. Кроме того, в основной экипаж корабля должен войти астронавт НАСА Скотт Тингл (Scott Tingle).

13 декабря 2015 года на форуме журнала 'Новости космонавтики' появилось сообщение, что в основном экипаже корабля 'Союз МС-06' Дениса Матвеева сменил Иван Вагнер.

3 - 5 февраля 2016 года условный экипаж в составе Ивана Вагнера, Скотта Тингла и инструктора ЦПК Александры Тюриной прошел тренировку по действиям в случае аварийной посадки в лесисто-болотистой местности зимой, во время которой экипаж отрабатывал операции, необходимые при выживании в случае нештатной посадки спускаемого аппарата.