Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.fbb.msu.ru/FBB/year_02/science_1/themes_2004f/Muronets.doc Дата изменения: Wed Dec 1 22:07:04 2004 Дата индексирования: Fri Dec 21 21:52:57 2007 Кодировка: koi8-r Поисковые слова: п п п п п п п

«Изучение влияния шаперонина GroEL на агрегацию белков».
Руководитель проф. Владимир Израилевич Муронец, корп.А -435-437 к., корп.
В. - 417к., тел. 939-14-56, Е.mail - vimuronets@belozersky.msu.ru
Экспериментальная задача для студента 3 курса.
Шапероны (или белки теплового шока) необходимы для правильного
сворачивания полипептидных цепей и денатурированных белков в клетке. Эти
белки также вовлечены в образование амилоидных структур (белковых
агрегатов) при ряде нейродегенеративных заболеваний. Главной целью проекта,
составной частью которого будет данная задача, является изучение роли
шаперонов (в том числе, шаперонина GroEL) в развитии амилоидоподобных
заболеваний (от прионовых болезней до болезни Альцгеймера) и попытка
создания лекарственных препаратов на основе полученной информации. При
выполнении работы необходимо будет изучить агрегацию ряда белков в
присутствии шаперонина GroEL (с помощью спектральных методов), а также
влияние природной модификации белков (прежде всего перекисного окисления)
на этот процесс.
Основные публикации группы по данной тематике:
1. Bulatnikov I.G., Polyakova O.V., Asryants R.A., Nagradova N.K.,
Muronetz V.I. Participation of chaperonin GroEL in the folding of D-
glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase. An approach based on the use
of different oligomeric forms of the enzyme immobilized on sepharose.
J. Protein Chem. 1999, 18: 79-87.
2. Roitel O., Ivinova O., Muronetz V., Nagradova N., Branlant G. Thermal
unfolding used as a probe to characterize the intra- and intersubunit
stabilizing interactions in phosphorylating D-glyceraldehyde-3-
phosphate dehydrogenase from Bacillus stearothermophilus.
Biochemistry. 2002, 41: 7556-7564.
3. Arutyunova E.I., Arutyunov D.Y., Pleten' A.P., Nagradova N.K.,
Muronetz V.I. Antibodies specific to modified glyceraldehyde-3-
phosphate dehydrogenase induce inactivation of the native enzyme and
change its conformation. Biochim Biophys Acta. 2004;1700(1):35-41.
4. Polyakova О.V. , Roitel O., Asryants R.A., Branlant G., Muronetz V.I.
Misfolded forms of glyceraldehydes-3-phosphate dehydrogenase interact
with GroEL and inhibit chaperonin-assisted folding of the wild-type
enzyme. Protein Science, 2005 (in press).
5. Муронец В.И. и Плетень А.П. Нобелевская премия получена - загадки
остались. Природа, 2005 (в печати).









«Идентификация сигналов ядерной локализации в пространственной структуре
глицеральдегид-3-фосфатдегидрогеназы».

Задача по биоинформатике для студента 2-3 курса.
Руководитель проф. Владимир Израилевич Муронец, корп.А -435-437 к., корп.
В. - 417к., тел. 939-14-56, Е.mail - vimuronets@belozersky.msu.ru
Известно, что гликолитический фермент глицеральдегид-3-
фосфатдегидрогеназа вовлечен в ряд важных для клетки процессов.
Например, этот белок участвует в индукции апоптоза - перемещается из
цитоплазмы в ядро и взаимодействует с РНК и ДНК. Недавно в первичной
структуре фермента были обнаружены последовательности, ответственные за
его транспорт в ядро и из ядра. В нашей работе было доказано, что
окисление фермента перекисью водорода может индуцировать его перемещение
в ядро Теперь надо связать те изменения, которые происходят с
четвертичной и третичной структурами белка при связывании субстратов и
кофакторов, а также при его окислении с изменением экспонированности
сигнальных последовательностей. На первом этапе надо сравнить доступность
этих последовательностей в апоферменте (белок без кофактора НАД), в
холоферменте (комплекс фермента с НАД) и в окисленных субъединицах белка,
а также провести моделирование структуры ГАФД, у которых данная
последовательность отсутствует. Если это удастся сделать, то можно понять
механизм механизм индукции апопотоза перекисными соединениями.
Основные публикации группы по данной тематике:
1. Arutyunov D.Y., Muronetz V.I. The activation of glycolysis performed
by the non-phosphorylating glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase in
the model system. Biochem. Biophys. Res. Commun. 2003, 300(1): 149-
154.
2. Ivinova O.N., Izumrudov V.A., Muronetz V.I., Galaev I.Y., Mattiasson
B. Influence of Complexing Polyanions on the Thermostability of Basic
Proteins, Macromolecular Bioscience. 2003, 3: 210-215.
3. Schmalhausen E.V., Pleten' A.P., Muronetz V.I. Ascorbate-induced
oxidation of glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase. Biochem.
Biophys. Res. Commun. 2003, 308(3): 492-496.
4. Arutyunova E.I., Danshina P.V., Domnina L.V., Pleten' A.P., Muronetz
V.I. Oxidation of glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase enhances
its binding to nucleic acids. Biochem Biophys Res Commun. 2003,
307(3): 547-552.
5. Schmalhausen E.V., Nagradova N.K., Boschi-Muller S., Branlant G.,
Muronetz V.I. Mildly oxidized GAPDH: the coupling of the dehydrogenase
and acyl phosphatase activities. FEBS Lett. 1999, 452: 219-222.
6. Grigorieva J.A., Dainiak M.B., Katrukha A.G., Muronetz V.I. Antibodies
to the nonnative forms of D-glyceraldehyde-3-phosphate dehydrogenase:
identification, purification, and influence on the renaturation of the
enzyme. Arch. Biochem. Biophys. 1999, 369: 252-260.