|
Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.cmm.msu.ru/~kozyavka/Evolution%20model.html
Дата изменения: Wed Mar 2 18:14:04 2005 Дата индексирования: Tue Oct 2 05:15:30 2012 Кодировка: Windows-1251 Поисковые слова: п п п п п п п п п п п п п п п п п п п п |
На основании скобочной структуры ((A:50,B:50):40,(((C:40,D:40):6,E:46):10, F:56):34) был воссоздан эволюционный путь белка UbiC. Поскольку в данной скобочной структуре эволюционные расстояния представляют собой число мутаций на 100 п.н., то они были переведены в число мутаций на полную последовательность гена. В результате было построено филогенетическое дерево белка UbiC.
msbar UbiC.fasta Mut1.fasta -point 4 -count 170 -auto msbar Mut1.fasta Mut2.fasta -point 4 -count 500 -auto msbar Mut1.fasta pointF.fasta -point 4 -count 280 -auto msbar Mut2.fasta Mut3.fasta -point 4 -count 30 -auto msbar Mut2.fasta pointE.fasta -point 4 -count 230 -auto msbar Mut3.fasta pointD.fasta -point 4 -count 200 -auto msbar Mut3.fasta pointC.fasta -point 4 -count 200 -auto msbar UbiC.fasta Mut4.fasta -point 4 -count 200 -auto msbar Mut4.fasta pointA.fasta -point 4 -count 250 -auto msbar Mut4.fasta pointB.fasta -point 4 -count 250 -auto
Определение эволюционного расстояния между нуклеотидными
последовательностями
Сравнение методов реконструкции деревьев