Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/~alcarin/Babkin_cr3.doc Дата изменения: Mon Dec 18 19:22:36 2006 Дата индексирования: Tue Oct 2 01:38:36 2012 Кодировка: koi8-r Поисковые слова: п п п п п п п п п п п п п п п п п п п п

Анализ протеома бактерии Staphylococcus aureus, штамм RF122.

П.Бабкин, студент 1 курса


Введение.

[Русское название]
Русское название бактерии Staphylococcus aureus - стафилококк золотистый.

[Таксономия]
Вид Staphylococcus aureus относят к роду Staphylococcus, семейству
Staphyloccacaeae, порядку Bacillales, классу Bacillii, царству Bacteria
[1]


[Размер, фотография]
[pic]
Вид бактерии под микроскопом см. в файле Staphylococcus aureus.jpg (взят с
сайта Http://wikipedia.com) . Длина бактерии примерно 0.5 мкм , толщина 1
мкм (http://www.mtonnel.ru)

[Среда (среды) обитания и условия]
Бактерия обитает на коже и слизистой носа человека. Типичные условия
существования -
Теже самые что и условия существования человека.(wikipedia.com).
[Чем интересна человеку, почему ее геном секвенирован]
Staphylococcus aureus очень интересна в связи ее способностью вызывать
такие заболевания как язвы, гнойнички, фурункулы, карбункулы на коже, реже,
(примерно в 25% случаев - воспаления в носу). Она может также обитать на
домашних животных, таких, как собаки и кошки. Она вызывает опухоли цевок у
кур.

Геном бактерии Staphylococcus aureus секвенирован для того, чтобы
способствовать разработке новых способов борьбы с ней.

[(*) Интересные особенности бактерии]
Также бактерия интересна своей феноменальной сопротивляемостью действию
антибиотиков, таких как пенициллин, так в США только 2% бактерий данного
вида чувствительны к пенициллину.

Для отбора статей, посвященных среде обитания Staphylococcus aureus,
написанных в 2006 году не на японском языке, был составлен запрос:
Staphylococcus aureus habitat 2006 NOT jpn
Статья о распространении Staphylococcus aureus в США:
http://www.pubmedcentral.nih.gov/articlerender.fcgi?tool=pmcentrez&artid=146
7003



Геном и протеом Staphylococcus aureus


[Статистические данные о геноме]
Статистические данные о геноме приведены в табл.1 Они взяты с сайта
http://www.ebi.ac.uk/genomes/bacteria.html

Табл.1 Статистические данные о геноме Staphylococcus aureus
|Хромосома |Число пар |Число генов |Суммарная |Суммарная |GC |
|или плазмида|нуклеотидов | |длина генов |длина |состав|
| | | |(% от длины |межгенных |(%) |
| | | |хромосомы |промежутков| |
| | | |или |(%) | |
| | | |плазмиды) | | |
|хр.1 |2742531 |2515 |84% |84% |32.8% |
|кольцевая | | | | | |

[Длины белков]
По данным с сайта http://www.ebi.ac.uk/genomes/bacteria.html число белков
протеома Staphylococcus aureus совпадает с числом генов. (*)Так как один
ген кодирует 1 белок протеома.

Так как по моему штаму в базе данных не было информации о длине белков, я
ипользовал информацию другого штамма Staphylococcus aureus(COL)
Средняя длина-289,
Максимальная-10498
Минимальная-21

Литература

[1]http://www.en.wikipedia.org/wiki/Staphylococcus_aureus
[2]http://www.mtonnel.ru/wiki/%D0%91%D0%B0%D0%BA%D1%82%D0%B5%D1%80%D0%B8%D0%
B8 (размеры Staphylococcus aureus)