Основная научная задача 'Спектр-УФ' - получение новых данных фундаментального значения по следующим направлениям астрофизики:

• Эволюция Вселенной - исследование природы темной энергии и темного вещества, поиск скрытого барионного вещества, исследование процессов реионизации и обогащения межгалактической среды тяжелыми элементами;
• Звездообразование - химическая эволюция галактик в ближней Вселенной;
• Аккреционные процессы в астрофизике - свойства аккреционных дисков в тесных двойных звездах, активных галактических ядрах;
• Межзвездная среда (МЗС) - определение содержания дейтерия в локальной МЗС, ионизационная структура МЗС;
• Физика звезд - физика белых карликов, природа звездного ветра (потери массы) у горячих звезд, хромосферная активность звезд;
• Планетные системы - физические и химические свойства комет и планетных атмосфер, включая планеты вокруг других звезд.