В течение первых семестров на соответствующих факультетах МГУ в Москве проходит обучение студентов по общеобразовательным дисциплинам. Группы, формируемые по представлению НЦЧ РАН, курируются учеными Научного центра, что существенно улучшает качество образования.

Обучение специальным дисциплинам, прохождение преддипломной практики, выполнение дипломных работ проходит в институтах Научного центра "Черноголовка" Академии наук (Институте физики твёрдого тела, Институте теоретической физики им. Л.Д.Ландау, Институте химической физики, Институте экспериментальной минералогии, Институте проблем микроэлектроники и особочистых материалов, Институте новых химических проблем, Космохимическом отделе Института геохимии и аналитической химии им. В.И.Вернадского, Институте структурной макрокинетики, Институте физиологически активных веществ и других институтах). В этих же институтах аспиранты (в аспирантуру принимаются все успешно закончившие наши кафедры - это одна из важных особенностей высшего образования в НЦЧ) будут работать над своими диссертационными работами.

Студенты и аспиранты, занимающиеся научной работой, получают дополнительное финансирование по научным грантам.