Новости химической науки > Ускорение считывания генетической информации

Разработанный шведскими исследователями метод высокопроизводительного скрининга генетической информации со временем может привести к разработке методов индивидуального медицинского лечения генетических заболеваний. В основе анализа лежит следующий подход: берется одна клетка, и выращивается колония ее клонов.

Флуоресцентная молекула-репортер позволяет определить различие между ДНК двух линий клеток, расположенных в микрорезервуарах. (Рисунок из Lab Chip, 2009, DOI: 10.1039/b912596e)

Исследователи под руководством Хелены Андерсон-Сван (Helene Andersson-Svahn) из Королевского Технологического Института (Стокгольм) скомбинировали несколько известных технологий в общую интегрированную систему. Клоны анализируемой клетки параллельно выращиваются в микрорезервуарах в составе прибора. После инкубации клетки разрушают, выделяя из них ДНК, после чего ее количество увеличивают с помощью метода ПЦР.

Полученная с помощью ПЦР двухцепочечная ДНК улавливается магнитными бусинами, после чего денатурируется с образованием одноцепочечной ДНК. На последней стадии к образцу добавляют молекулу-репортер, которая флуоресцирует при связывании с определенной последовательностью ДНК, что позволяет определить различия в исследуемых образцах. Новый метод позволил исследователям различить клетки человека, отличавшихся друг от друга строением лишь одного нуклеотида. Интегрированная система позволяет проводить все стадии анализа в одном микроустройстве.

Андерссон-Сван отмечает, что ей получена первая система, интегрирующая системы клонирования живых клеток с анализом ПЦР; главная цель исследования шведской команды - разработка быстрой, высокопроизводительной и дешевой системы для скрининга генов, такая система может оказаться востребованной для разработки методов для индивидуального подхода к лечению генетических заболеваний и некоторых форм рака.

Источник: Lab Chip, 2009, DOI: 10.1039/b912596e

метки статьи: #аналитическая химия, #биохимия, #медицинская химия, #молекулярная биология