Ну, насколько мне известно, геологи не только по скважинам и "косвенным данным" выводы делают. Есть ведь в конце-концов природные сверхглубокие скважины - вулканы

Есть и что? Вещество проходя сквозь кору уже видоизменяется, а излившись превращается в магматические породы. Несомненно мы имеем некоторое представление о химсоставе магмы, но этого очень мало.. нужно знать структуру глубинных горизонтов, процессы которые там проходят.. степень однородности/разнородности глубинных структур, реальные локальные плотности и многое другое.. Мы даже точно не знаем состав и структуру "нижней" земной коры.

Недра содержат еще очень много тайн и секретов, которые предстоит нам выяснить..

Вы, к примеру, знаете, что  наибольшие отрицательные гравитационные аномалии приходятся на области альпийской складчатости, т.е. самых высоких современных гор и самых мощных участков земной коры и этот феномен пока толком не могут объяснить.

Ну да, есть гипотезы из разряда "бредовых". Например, часть сторонников Хокинга в 70ых годах высказали идею о том, что источник тепла планет не столько сжатие и ядерные реакции, сколько аккреция на микро-ЧД в центре каждого сколько-нибудь крупного объекта. Так сказать, приравняли Землю и планеты к квантовым звездам, правда очень маленьким. Так что, если из вулкана выпрыгнет черная дыра, то мы узнаем, так это было или нет.

Не могли бы Вы  вразумительно ответить на поставленные мной ранее 12 вопросов.

Уважаемый Novoselov, увы, не на каждый вопрос можно ответить. Ответы возможны только на вопросы, не выходящие столь далеко за рамки научной парадигмы. А насчет водорода - здесь Вы далеко не обладаете приоритетом. Гипотезы о небиогенной нефти и газе стары как мир. Они обсуждаются уже, минимум, сорок лет. С тех пор как обнаружены первые небиогенные углеводороды в космосе. В частности, вся атмосфера некоторых спутников больших планет - метановый бак.

А насчет водорода - безусловно и речи нет о приоритете...  - приоритет совсем в другом в более широком смысле ...
 Мой взгляд на происхождение нефти и газа не в коей мере нельзя назвать небиогенным - если кратко то, нефть и газ образовались из угля и другой органики при воздействии тепла и глубинного потока в первую очередь водорода.   

Как вариант - вполне возможно.