|
Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес
оригинального документа
: http://kodomo.cmm.msu.ru/~julia_p/P21888.html
Дата изменения: Sun Apr 26 21:06:11 2009 Дата индексирования: Tue Oct 2 00:25:24 2012 Кодировка: Windows-1251 Поисковые слова: цинк |
Таблица об P21888:
| Метка поля | Содержание | |
| Код(ы) доступа ("Accession number") | AC | P21888; Q2MBQ3; |
| Идентификатор записи в БД | ID | SYC_ECOLI |
| Название (краткое описание) белка | DE | RecName: Full=Cysteinyl-tRNA synthetase; EC=6.1.1.16; AltName: Full=Cysteine--tRNA ligase; Short=CysRS; |
| Дата создания документа | DT | 01-MAY-1991 |
| Дата последнего исправления аннотации | DT | 16-DEC-2008 |
| Число публикаций, использованных при создании документа | RN | 8 |
| Журнал и год самой поздней публикации | RL | EMBO J. 21:2778-2787(2002) |
| Ключевые слова | KW | 3D-структура; Аминоацил-тРНК синтетаза; АТФ-связывающая;Полный протеом; Цитоплазма; Прямая белковая последовательность; Лигаза; Металл-связывающая; Нуклеотид-связывающая; Протеиновый биосинтез; Цинк. |
| Что содержит поле комментариев? | CC | Каталитическая активность: АТФ + L-цистеин + тРНК(Cys) = АМФ + дифосфат + L-цистеинил-тРНК(Cys). Кофактор: связывает 1 цинк ион в подразделения. Отдел: Мономер. Субклеточное расположение: Цитоплазма. Сходства:семейство-I аминоацил-тРНК синтетаз семейства. |
| Идентификаторы записей PDB | DR | PDB; 1LI5; X-ray; 2.30 A; A/B=1-461. PDB; 1LI7; X-ray; 2.60 A; A/B=1-461. PDB; 1U0B; X-ray; 2.30 A; B=1-461. |
К белку cysS могут присоединяться нуклеотиды и АТФ ,а так же ион цинка ,который является кофактором реакции
ATP + L-cysteine + tRNA(Cys) = AMP + diphosphate + L-cysteinyl-tRNA(Cys).Следовательно соеденяются с белком L-цистеин и тРНК.
Таблица , характеризующая число записей по разным запросам на сайте UniProt:
| Запрос | Число записей в SwissProt |
Число записей в TrEMBL |
| Cysteinyl-tRNA synthetase | 576 | 888 |
| EC=6.1.1.16 | 564 | 494 |
| Cysteine--tRNA ligase | 574 | 871 |
| CysRS | 567 | 8 |
| "Cysteinyl-tRNA synthetase EC=6.1.1.16" | 0 | 3 |
Таблица сравнения белка P21888 и белка P49589
(белок P49589 получен в результате запроса "Cysteinyl-tRNA")
| Метка поля | Белок P21888 | Белок P49589 | |
| Первый код доступа | AC | P21888; Q2MBQ3; | P49589; Q53XI8; Q9HD24; Q9HD25; |
| Идентификатор последовательности в БД | ID | SYC_ECOLI | SYCC_HUMAN |
| Название (краткое описание) белка | DE |
RecName: Full=Cysteinyl-tRNA synthetase; EC=6.1.1.16; AltName: Full=Cysteine--tRNA ligase; Short=CysRS; |
RecName: Full=Cysteinyl-tRNA synthetase, cytoplasmic; EC=6.1.1.16; AltName: Full=Cysteine--tRNA ligase; Short=CysRS; |
| Дата создания документа | DT | 01-MAY-1991 | 01-FEB-1996 |
| Дата последнего исправления аннотации | DT | 16-DEC-2008 | 20-JAN-2009 |
| Название организма | OS | Escherichia coli (strain K12) | Homo sapiens (Human) |
| Классификация организма (список таксонов) | OC | Bacteria; Proteobacteria; Gammaproteobacteria; Enterobacteriales; Enterobacteriaceae; Escherichia. | Eukaryota; Metazoa; Chordata; Craniata; Vertebrata; Euteleostomi; Mammalia; Eutheria; Euarchontoglires; Primates; Haplorrhini; Catarrhini; Hominidae; Homo. |
| Длина последовательности | SQ | 461AA | 748AA |
| Молекулярная масса белка | SQ | 52202MW | 85473MW |
| Число публикаций, использованных при создании документа | RN | 8 | 7 |
| Журнал и год самой поздней публикации | RL | EMBO J. 21:2778-2787(2002) | Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A. 105:10762-10767(2008). |
| Описание вторичной структуры | FT | CHAIN 1 461 Cysteinyl-tRNA synthetase. FTId=PRO_0000159394.MOTIF 30 40 "HIGH" region. MOTIF 266 270 "KMSKS" region. |
CHAIN 1 748 Cysteinyl-tRNA synthetase, cytoplasmic. /FTId=PRO_0000159550. MOTIF 57 67 "HIGH" region. MOTIF 406 410 "KMSKS" region. |
| Ключевые слова | KW | 3D-структура; Аминоацил-тРНК синтетаза; АТФ-связывающая; Полный протеом; Цитоплазма; Прямая белковая последовательность; Лигаза; Металл-связывающая; Нуклеотид-связывающая; Протеиновый биосинтез; Цинк. | Альтернативное сшивание; Аминоацил-тРНК синтетаза; АТФ-связывающая; Хромосомная перестройка; цитоплазма; Лигаза; Металл-связывающая Фосфопротеин; Нуклеотид-связывающая; Протеиновый биосинтез; Первичный онкоген; Цинк |
| Темы, освещенные в комментариях | CC |
Каталитическая активность: АТФ + L-цистеин + тРНК(Cys) = АМФ + дифосфат + L-цистеинил-тРНК(Cys) Кофактор: связывает 1 цинк ион в подразделения. Отдел: Мономер. Субклеточное расположение: Цитоплазма. Сходства: семейство-I аминоацил-тРНК синтетаз семейства. |
Каталитическая активность: АТФ + L-цистеин + тРНК(Cys) = АМФ + дифосфат + L-цистеинил-тРНК(Cys) Кофактор: связывает 1 цинк ион в подразделения. Отдел: Мономер. Субклеточное расположение: Цитоплазма. Альтернативные продукты: Альтернативное сшивание; две изоформы, Болезни: хромосомное отклонение, затрагивающее CARS,связанное с возбуждающими фибробастическими новообразованиями (IMTs) изменение в щелочности. Сходство: семейство- аминоацил-тРНК синтетаз семейства. Предупреждение об ошибках в последовательности: Sequence=AAA73901.1; Type=Frameshift; Positions=619; WEB ресурсы: Name=Atlas of Genetics and Cytogenetics in Oncology and Haematology; URL="http://atlasgeneticsoncology.org/Genes/CARSID484.html"; |
| Особенности последовательности | FT |
Цепь - одна, 461 аминокислота; цистеинил-тРНК синтетаза Область модификации - 30-40-й остаток и 266-270-й остаток; к остаткам под номерами 28, 209, 234,238 присоединен металл-лиганд - Zinc. Связывающий АТФ остаток 269, конфликт в районе 316 остатка- L -> V (in Ref. 1; CAA39691)-переход лейцина в валин. Бета -тяжи - 3-5,10-14,22-27,31-34,60-65,133-136,142-144,181-186, 200-203,219-225,246-248,251-254,260-262,302-304,406-408,447-451,456-460. Виток-7-9,150-157,231-233,389-392.Альфа-спирали- 38-57,72-80,85-102,14-116, 118-130,146-148,207-217,228-230,234-245,269-271,277-281,286-294,306-323, 336-347,352-372,374-388,398-401,413-416,419-428,432-444 |
Цепь - одна, 748 аминокислот; цистеинил-тРНК синтетаза, цитоплазматический. Область модификации - 57-67-й остаток и 406-410-й остаток; К остаткам под номерами 55, 348, 373,377 присоединен металл-лиганд - Zinc. Связывающий АТФ остаток 409.260 остаток-фосфотирозин,307 и 746 остатки фосфосерин. Варианты в последовательности с 705-748 остатки GLPTHDMEGKELSKGQAKKLKKLFEAQEKLYKEYLQMAQNGSFQ-> VSMVCPHMTWRAKSSAKGKPRS (in isoform2). |
| Идентификаторы записей PDB | DR | PDB; 1LI5; X-ray; 2.30 A; A/B=1-461. PDB; 1LI7; X-ray; 2.60 A; A/B=1-461. PDB; 1U0B; X-ray; 2.30 A; B=1-461. | отсутствует |