Документ взят из кэша поисковой машины. Адрес оригинального документа : http://kodomo.cmm.msu.ru/FBB/year_02/science_1/themes_2004f/EVrzheshch.doc
Дата изменения: Thu Dec 16 22:19:50 2004
Дата индексирования: Sat Dec 22 07:29:51 2007
Кодировка: koi8-r

Поисковые слова: флуоресценция


Курсовые работы для студентов 1-3 курсов



[pic]

Немного о о семействе флуоресцентных белков ( FP):
Флуоресцентные белки широко используются в биохимии, биотехнологии,
клеточной биологии и биологии развития. Уникальной особенностью этого
класса гомологичных хромопротеинов является протекающее без участия
экзогенных кофакторов и субстратов (за исключением растворенного
кислорода) внутримолекулярное автокаталитическое образование хромофорной
группы. Это делает их превосходными in vivo маркерами экспрессии генов и
локализации белков для различных биологических систем. Необходимым
условием флуоресценции образованного хромофора является наличие
окружающей хромофор белковой оболочки - бета-бочонка (на рисунке
изображен красным цветом). Хромофор находится близко к геометрическому
центру цилиндра, приблизительно на середине нерегулярной ?-спирали.
Благодаря уникальной структуре белка его хромофор оказывается совершенно
изолированным от окружающего молекулу FP растворителя, что позволяет
избежать доступа внутрь хромофора молекул кислорода и других веществ и
предотвращает диссипацию энергии хромофора путем изомеризации связей или
за счет колебательных процессов. В настоящее время имеется несколько
десятков представителей флуоресцентных белков (FP) и нефлуоресцирующих
хромопротеинов (CP). Идет активный поиск новых представителей этого
семейства среди различных видов живых организмов. Актуальной задачей в
настоящее время является осмысление связи между структурой флуоресцентных
белков и их свойствами (спектры поглощения и флуоресценции, квантовый
выход флуоресценции и пр.). Выполнение настоящей курсовой работы будет
шагом в данном направлении, станет частью научной публикации и получит
экспериментальное развитие в нашей научной группе.




1.
"Поиск аминокислотных остатков, влияющих на спектральные свойства
флуоресцентных белков, с помощью методов квантовой химии"

Цель работы - выяснение особенностей строения mRFP1 для получения
улучшенных мутантов и сенсоров на его основе.

Работа включает в себя
- теоретическое введение. Обзор литературы. Флуоресцентные
белки и хромопротеины семейства GFP. Красный флуоресцентный
белок, выделенный из морского коралла Discosoma striata.
- ознакомление с квантовой механикой, квантовой химией, оптикой.
- построение моделей хромофоров флуоресцентных белков, полученных
в нашей лаборатории in vivo, теор. рассчет их свойств.
- изучение взаимодействий между аминокислотными остатками в
существующих белках ( mRFP1, GFP, CFP, DsRed и аналогичные им),
поиск "переключателей флуоресценции".
- предсказание свойств новых мутантов








2.
"Изучение спектральных свойств новых мутантов флуоресцентного белка mRFP1"


практическая работа

Цель работы - изучение свойств новых мутантов mRFP1
Работа включает в себя
- теоретическое введение. Обзор литературы. Флуоресцентные
белки и хромопротеины семейства GFP. Красный флуоресцентный
белок, выделенный из морского коралла Discosoma striata.
- исследование спектральных свойств белков - поглощение и
флуоресценция в зависимости от уровня pH и ионной силы
- исследование кинетики денатурации и ренатурации
- исследование температурной зависимости флуоресценции


Руководитель работы:
Аспирант Вржещ Евгений Петрович, к. 612 Лабораторного корпуса Б, тел.
938-2323, mailto: evrzheshch@rambler.ru

Супервайзер:
профессор Вржещ Петр Владимирович, факультет биоинженерии и
биоинформатики МГУ, к. 610 Лабораторного корпуса Б, тел. 939-4218,
mailto: peter@genebee.msu.ru