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Дата изменения: Thu Oct 4 23:25:45 2012
Дата индексирования: Mon Feb 4 07:35:59 2013
Кодировка:

Поисковые слова: m 2
# File 2gws.pdb4.pdb, PDB XXXX
# Hydrogen bonds
# NA Atom Protein Atom Dist. Theta1 Theta2 Phi1 Phi2 Power
DC4:N.OP1/1 LYS521:M.NZ/1 2.66 1.27 1.23 2.66 -0.48 0.906
DA5:N.OP2/1 ARG517:M.NE/1 2.98 0.71 0.28 -2.55 0.59 0.420
DA5:N.OP2/1 ARG517:M.NH2/1 2.99 0.80 1.45 1.42 -1.72 0.337
DC9:N.OP1/1 GLU466:M.N/1 2.89 1.02 0.09 2.59 -0.55 0.909
DC11:N.OP1/1 THR371:M.N/1 3.18 0.39 0.28 1.31 -1.83 0.109
DC11:N.OP1/1 THR371:M.OG1/1 2.96 0.89 1.50 1.22 -1.92 0.245
DG3:R.OP1/1 LYS347:M.NZ/1 2.88 1.03 0.91 1.67 -1.47 0.690
DC4:R.OP1/1 GLY345:M.N/1 3.00 1.37 0.70 2.12 -1.02 0.445
DC4:R.OP1/1 THR348:M.N/1 2.60 0.76 0.31 0.27 -2.87 0.510
DC4:R.OP1/1 THR348:M.OG1/1 2.60 0.82 1.51 -0.35 2.79 0.299
DC4:R.OP2/1 LYS347:M.N/1 3.11 1.41 0.35 0.65 -2.49 0.510
DC4:R.O5'/1 GLY345:M.N/1 3.07 0.53 0.98 1.18 -1.96 0.123
DG5:R.OP1/1 GLY343:M.N/1 2.84 0.88 0.51 -0.67 2.47 0.608
DG6:R.OP1/1 TRP342:M.NE1/1 3.12 1.24 0.10 -0.16 2.98 0.719
DG6:R.OP1/1 ARG488:M.NH2/1 2.76 0.91 1.24 -1.48 1.66 0.719
DG6:R.O3'/1 LYS472:M.NZ/1 3.29 -1.00 1.06 0.00 1.59 0.370
DG1:Q.OP1/1 TYR267:M.OH/1 2.62 0.47 1.10 -0.19 2.95 0.215
DG1:Q.OP1/1 TYR279:M.OH/1 2.67 1.35 0.83 2.44 -0.70 0.504
DC2:Q.OP1/1 GLY306:M.N/1 2.84 0.93 0.63 2.89 -0.25 0.558
DC2:Q.OP1/1 MET309:M.N/1 2.96 0.97 0.37 1.00 -2.14 0.794
DC3:Q.OP1/1 GLY304:M.N/1 2.82 1.00 0.04 1.44 -1.71 0.888
# Water bridges
# NA Atom Protein Atom NA-HOH Prot.-HOH Theta1 Theta2 Phi1 Phi2 Power
DA5:N.OP2/1 ARG514:M.O/1 2.89 2.75 1.30 0.89 2.67 -0.83 0.511
DA10:N.OP1/1 SER463:M.N/1 2.74 2.68 0.46 0.17 1.70 -0.51 0.214
DA10:N.OP1/1 GLN464:M.N/1 2.90 3.17 1.08 0.55 -2.91 -0.74 0.387
DA10:N.OP1/1 GLN464:M.O/1 2.90 2.76 1.08 0.94 -2.91 -0.22 0.578
DA10:N.O3'/1 GLN372:M.N/1 2.91 2.99 0.30 0.27 1.51 -1.84 0.702
DG5:R.OP2/1 SER339:M.O/1 2.67 3.18 1.29 0.77 1.10 -2.38 0.116
DG5:R.OP2/1 ALA344:M.O/1 2.67 2.98 1.29 0.78 1.10 2.72 0.305
DG5:R.N2/1 GLU465:M.OE1/1 3.10 2.86 0.84 1.16 -3.13 1.36 0.427
DG5:R.N2/1 LYS472:M.NZ/1 3.10 2.62 0.84 1.49 -3.13 -0.38 0.261
DG6:R.O3'/1 ASP429:M.OD1/1 2.66 3.17 -1.00 1.34 0.00 -1.75 0.209
DG6:R.O3'/1 ASP490:M.OD1/1 2.66 2.85 -1.00 1.13 0.00 -3.05 0.864
DG6:R.N2/1 TYR505:M.OH/1 2.86 2.99 0.89 1.25 -2.71 -1.33 0.404
DG6:R.N2/1 GLU529:M.OE2/1 2.86 2.77 0.89 1.13 -2.71 0.44 0.688
DG6:R.N3/1 LYS472:M.NZ/1 2.79 2.92 0.13 0.45 -2.43 2.49 0.206
DC2:Q.OP2/1 LYS307:M.N/1 2.80 2.89 1.02 0.95 2.48 -1.04 0.179
DC2:Q.OP2/1 ARG308:M.N/1 2.80 3.27 1.02 0.10 2.48 -2.03 0.368
DC3:Q.OP1/1 CYS300:M.O/1 2.88 2.66 1.09 0.80 1.78 -1.33 0.454
DC3:Q.OP1/1 ILE302:M.O/1 2.88 2.79 1.09 1.15 1.78 -1.49 0.747
DC3:Q.OP1/1 ILE305:M.O/1 2.88 2.64 1.09 0.62 1.78 -2.80 0.269